4 juin 2009, 15 h 20 min
J’ai publié précédemment des infographies créées pour ma thèse de doctorat, par exemple la comparaison des objects biologiques et technologiques à l’échelle du micro- et nanomètre. Voici quelques autres infographies réalisées pour expliquer les utilisations possibles du poly(N-isopropylacrylamide) (PNIPAM) dans les domaines de la biologie et la santé.
Changement conformationnel
Changement conformationnel du PNIPAM induit par la température.
Le PNIPAM est un polymère thermosensible qui subit une transition conformationnelle réversible autour de sa température critique inférieure de solution (~32°C). Il passe d’un état hydrophile et gonflé à un état hydrophobe et replié.
Immunotest basé sur le PNIPAM
Immuno-test basé sur la précipitation thermique du PNIPAM
Les propriétés particulières du PNIPAM permettent d’utiliser ce polymère comme support d’immuno-test basé sur la précipitation thermique.
Culture de cellules
Culture de cellules sur des surfaces recouvertes de PNIPAM
Les surfaces recouvertes de PNIPAM peuvent être utilisées comme support souple de culture de cellules. Les cellules sont cultivées sur du PNIPAM hydrophobe et sont doucement relarguées en abaissant la température et rendant le PNIPAM hydrophile.
Adsorption et relargage de protéines
Adsorption et relargage contrôlés de protéines sur du PNIPAM (application : préconcentration)
De la même façon que les cellules s’adsorbent sur une surface de PNIPAM hydrophobe, les protéines peuvent être piégées réversiblement sur une surface de PNIPAM, puis relarguées sur commande. C’est notamment un des résultats de mes travaux de thèse de doctorat.
Licence et réutilisation
Il s’agit d’images vectorielles SVG, ce qui signifie qu’elles peuvent être redimensionnées à volonté sans perte de qualité ou pixellisation. Ce travail est publié sous une licence Creative Commons Paternité Partage à l’identique, ce qui signifie que vous êtes libre de l’utiliser, le modifier et le redistribuer pour tout usage tant que vous indiquez clairement que j’en suis l’auteur et que vous redistribuez les éventuels travaux dérivés sous la même licence.
21 avril 2009, 8 h 49 min
Aperçu du CV
Je suis toujours à la recherche de nouvelles collaborations professionnelles. Mon CV précédent était un CV scientifique, propre dans sa forme et sa mise en page. Je l’avais réalisé avec LaTeX et il m’a permis de décrocher mes deux derniers emplois en tant que chercheur. Cependant, en prenant un peu de recul, ce CV classique était aussi ennuyeux que les documents que je critique habituellement. J’ai donc décidé d’appliquer mes propres conseils et de faire en sorte que l’apparence soit au niveau du contenu.
Le contenu était assez stable et à jour; je savais qu’il n’allait pas changer radicalement. Je me suis donc concentré sur l’apparence, raison pour laquelle j’ai choisi de créer ce nouveau CV avec Scribus, mon logiciel de PAO favori.
Un profil double-compétence
J’ai un profil particulier. D’un côté, j’ai suivi un cursus scientifique de haut niveau en ingénierie, physique et micro-électronique. Je suis diplômé d’une Grande école et j’ai un master en nanotechnologies et nanosciences. J’ai obtenu mon doctorat dans le domaine des microsystèmes pour le vivant et des laboratoires sur puce. Toutes ces missions ont été au carrefour de la technologie, la biologie et la chimie (lire mon article sur l’interdisciplinarité).
D’un autre côté, je travaille bénévolement pour la Wikimedia Foundation depuis environ deux ans et demi maintenant, dans le domaine de la communication et du marketing. J’ai répondu à la presse, travaillé avec le chargé de communication de la Foundation, et créé un certain nombre de documents institutionnels. Je gère également le service de relation client et recrute de nouveaux bénévoles pour répondre au courrier électronique envoyé par le public ; enfin, j’ai récemment lancé un projet de ménage et mise à jour des documents de marketing et relations publiques.
Une apparence et une mise en page cohérentes avec le contenu
Je voulais vraiment que mon CV montre ces deux faces de mon profil. Après beaucoup de réflexion et de nombreux essais, je suis parvenu à un sympathique style en deux colonnes qui utilise mon jeu de couleurs favori (le même que pour le nouveau logo d’unfoldscience). Chaque colonne est dédiée à l’un des côtés de mon expérience et les deux amènent de façon naturelle aux collaborations professionnelles que je recherche maintenant.
Intéressé ?
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19 décembre 2008, 14 h 29 min
Aperçu de la thèse
Je suis heureux d’annoncer que ma thèse de doctorat est maintenant disponible en ligne. Ce document, fruit de trois ans de travail de recherche, est intitulé Technologies PNIPAM pour les laboratoires sur puce. Il contient notamment de jolies images dont j’ai donné un aperçu précédemment avec l’infographie « Interdisciplinarité, biologie et micro-nanotechnologies ».
Résumé
Les laboratoires sur puce sont des dispositifs intégrés rassemblant, sur un substrat miniaturisé, une ou plusieurs fonctions de laboratoire, généralement dédiées à la manipulation d’échantillons chimiques ou biologiques. L’objectif de ces travaux est l’intégration dans les microsystèmes d’un polymère intelligent, le poly(N-isopropylacrylamide) (PNIPAM), afin de développer une nouvelle filière technologique pour les laboratoires sur puce.
Le PNIPAM est un polymère thermosensible subissant un changement réversible, d’un état hydrophile et gonflé sous sa température de transition (LCST ~ 32°C) à un état hydrophobe et replié au-delà. La technologie développée repose sur des éléments chauffants et un protocole de greffage du PNIPAM sur des surfaces.
Nos travaux montrent que le contrôle thermique du PNIPAM permet de moduler le flux électro-osmotique, ouvrant ainsi la voie au développement de mélangeurs électrocinétiques. Ce contrôle permet également l’accrochage, partiellement réversible, de protéines sur des billes fonctionnalisées, pour des applications dans le domaine de la préparation d’échantillon.
Mots-clés : Laboratoire sur puce, NIPAM, microfluidique, polymère thermosensible.
Outils
J’ai principalement utilisé LaTeX pour réaliser ce document. Toutes les infographies vectorielles ont été créées avec Inkscape.
Bien que le PDF accepte les recherches en plein texte, j’ai également commencé à convertir le document en wikitexte, afin de rendre tout le contenu disponible librement sur Wikisource. Cependant, ce processus prend du temps et j’ai d’autres priorités pour le moment, donc toute aide est bienvenue.
Licence et réutilisation
J’ai publié le document entier sous licence GFDL, ce qui signifie que vous êtes libre de l’utiliser, le modifier et le redistribuer pour tout usage tant que vous indiquez clairement que j’en suis l’auteur et que vous redistribuez les éventuels travaux dérivés sous la même licence. Vous devez également fournir une copie de la licence.
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8 juillet 2008, 7 h 29 min
La convergence entre objets technologiques et naturels à l’échelle du micro et du nanomètre est soulignée depuis longtemps, y compris par Stanley Fields dont la déclaration est devenue célèbre :
Because technology provides the tools and biology the problems, the two should enjoy a happy marriage.
Ce qui peut être librement traduit par :
Le vivant ayant apporté les problèmes et la technologie ayant fourni les outils pour les résoudre, ils se marièrent et eurent beaucoup d’enfants.
Bien que cette affirmation soit extrêmement réductrice, biologie et technologie vivent réellement une grande histoire d’amour, et j’en ai fait l’expérience durant les trois dernières années. Mon travail de doctorat a été très interdisciplinaire et je souhaitais dédier une section de ma thèse à la gratification que l’on retire à travailler au carrefour de la biologie, la chimie, la physique et la technologie, même si ce n’est pas sans efforts. Puisqu’une image vaut mille mots, j’ai construit une frise comparative de plusieurs objets biologiques et réalisations technologiques de référence à l’échelle du micro- et du nanomètre. La plupart des images utilisées pour l’assemblage étaient partagées sur Wikimedia Commons et j’ai réalisé les autres moi-même.
Comparaison des échelles biologique et technologique.
Il s’agit d’une image vectorielle SVG, ce qui signifie qu’elle peut être redimensionnée à volonté sans perte de qualité ou pixellisation. Ce travail est publié sous une licence Creative Commons Paternité Partage à l’identique, ce qui signifie que vous êtes libre de l’utiliser, la modifier et la redistribuer pour tout usage tant que vous indiquez clairement les auteurs et que vous redistribuez les éventuels travaux dérivés sous la même licence.
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Notes
7 février 2008, 20 h 18 min
Aperçu du poster
En Janvier, j’ai participé à la conférence Biodevices à Funchal (Madère). Biodevices est le nom court de l’International conference on biomedical electronics and devices. J’y ai présenté un poster intitulé Thermoresponsive polymer-based microdevice for nano-liquid chromatography. Nous aurions de loin pu soumettre une présentation plutôt qu’un poster, mais mes directeurs avaient un autre avis.
J’ai réutilisé le graphisme fait avec Scribus pour MicroTAS 2007 et j’en ai fait un poster assez sympathique que je partage maintenant avec vous. Certains lecteurs PDF peuvent avoir quelques difficultés à afficher ce fichier car il utilise la transparence et des calques. Je recommande d’utiliser la dernière version d’Adobe Reader.
Comme d’habitude, tout le poster (sauf les logos en haut et l’en-tête) est distribué sous une licence Creative Commons Paternité Partage à l’identique, ce qui signifie que vous êtes libre de l’utiliser, le modifier et le redistribuer pour tout usage tant que vous indiquez clairement que j’en suis l’auteur et que vous redistribuez les éventuels travaux dérivés sous la même licence.
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21 décembre 2007, 21 h 41 min
Je travaille actuellement au LAAS-CNRS (Laboratoire d’analyse et d’architectures des systèmes) à Toulouse (France). Le laboratoire a récemment subi de gros travaux d’extension avec la construction de deux nouveaux bâtiments, dont l’un héberge la toute nouvelle centrale de technologie micro-électronique. Il s’agit principalement d’une salle blanche de 1500 m² utilisée pour la réalisation et l’assemblage de micro- et nanosystèmes dans un environnement dénué de poussières.
Inauguration
Cette nouvelle salle blanche a été récemment inaugurée par les élus locaux. En tant que photographe officiel pour cet évènement, j’ai également eu l’opportunité de prendre quelques photos de la centrale de technologie elle-même et des équipements. J’ai placé ces photos sous une licence libre et je les ai téléchargées sur Wikimedia Commons, la médiathèque libre.
Cérémonie d'inauguration
Galerie d’exemples
Toutes ces images peuvent en particulier servir à illustrer les articles de Wikipedia sur ce sujet, comme par exemple Oxydation thermique ou Dépôt chimique en phase vapeur assisté par plasma (PECVD). Dès qu’un fichier multimédia est ajouté à Wikimedia Commons, il peut être utilisé sur tous les sites collaboratifs hébergés par Wikimedia, comme Wikipedia en russe ou en japonais.
Cuves de gravure
Machines d'alignement sous lumière inactinique
Appareil d'épitaxie à jets moléculaires
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14 octobre 2007, 21 h 15 min
J’ai récemment participé à la conférence internationale MicroTAS à Paris. MicroTAS (connu également sous le nom de « µTAS ») est le nom court de l’International conference on biomedical electronics and devices. J’y ai présenté un poster intitulé Electrokinetic mixers based on stimuli-responding surfaces. J’étais également le photographe officiel de la conférence (je posterai quelques photos plus tard).
Outils
La plupart de mes collègues (sinon tous) utilisent PowerPoint pour réaliser leurs posters. Outre le fait que c’est un logiciel propriétaire et coûteux, il en reste également un programme de présentation créé pour… faire des présentations. Un poster n’est pas une présentation et il existe pour cela des outils bien plus appropriés tels que des logiciels de PAO.
J’utilise un logiciel libre de PAO baptisé Scribus depuis quelque temps maintenant et je ne jure que par lui. Scribus supporte les calques, possède un très bon système de gestion des couleurs et propose une fonctionnalité d’export PDF d’excellente qualité; il a même supporté l’export en PDF/X-3 avant tout autre logiciel (propriétaire ou non).
La Grande Vague
Les « sessions poster » des conférences internationales sont la plupart du temps soporifiques. Les chercheurs oublient souvent que les scientifiques qui assistent à une conférence ont très peu de temps à consacrer aux posters. J’ai donc décidé d’utiliser un design original pour attirer les visiteurs, à qui je pourrais ensuite vanter mes résultats de recherche. Le sujet de mon poster était une nouvelle méthode de création de vagues dans des microcanaux en utilisant des mélangeurs basés sur des polymères. En naviguant dans la catégorie « Waves » (« vagues ») de Wikimedia Commons, la médiathèque libre, je me suis rappelé de cette vieille peinture japonaise intitulée La Grande Vague de Kanagawa. J’ai trouvé une version en haute résolution et je l’ai utilisée comme image de fond pour mon poster A0 poster.
Copie de « La Grande Vague de Kanagawa »
Aperçu du poster
Conclusion : l’apparence compte
Bien entendu, mon poster a reçu bien plus d’attention que ses voisins. Les chercheurs asiatiques, en particulier, l’ont trouvé particulièrement original, et ils représentaient une portion non négligeable des visiteurs. On n’attrape pas les mouches avec du vinaigre, dit le proverbe. C’est également vrai pour la communication scientifique : on obtient beaucoup plus d’attention de la part des chercheurs en créant des documents originaux et attractifs plutôt qu’en utilisant des documents ennuyeux et mal conçus.
Il est à vous !
La version PDF haute-resolution du poster est disponible au téléchargement ci-dessous. Certains lecteurs PDF peuvent rencontrer des difficultés à afficher ce fichier, car il utilise la transparence et des calques. Je conseille d’utiliser la dernière version d’Adobe Reader.
Comme d’habitude, tout le poster (sauf les logos en haut et l’en-tête) est distribué sous une licence Creative Commons Paternité Partage à l’identique, ce qui signifie que vous êtes libre de l’utiliser, le modifier et le redistribuer pour tout usage tant que vous indiquez clairement que j’en suis l’auteur et que vous redistribuez les éventuels travaux dérivés sous la même licence.
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